В последние годы тема недостающей наследственности стала предметом интенсивных дискуссий в научном сообществе и за его пределами. Исследования в области генетики стремятся понять, почему результаты анализа наследуемости по данным геномных исследований часто существенно ниже показателей, получаемых классическими методами, такими как исследования двойняшек и приёмных детей. Эти расхождения вызывают как интерес, так и значительные споры, порождая широкий спектр гипотез и теорий. Одним из важнейших аспектов обсуждения стал вопрос взаимодействия генов между собой и с окружающей средой. Классическая генетика, в частности методология исследований близнецов, зачастую не отделяет взаимодействия генов от взаимодействия генов с общим окружением, что может приводить к переоценке наследуемости.
Действительно, есть веские доказательства существования значимых взаимодействий гена и среды (GxE), особенно в таких фенотипах, как показатель интеллекта, уровень образования и индекс массы тела. Исследования показывают, что среда может усиливать или ослаблять генетические эффекты, что сложно адекватно учесть в аналитических моделях. Однако следует отметить, что прямые доказательства взаимодействий генов друг с другом (GxG), особенно доминирования генов, оказываются весьма ограниченными. Теоретически, если бы не учитывались взаимодействия генов и среды, исследования могли бы недооценивать наследуемость. Но некоторые данные свидетельствуют о том, что именно переоценка также возможна, если ошибки в допущениях моделей приводят к приписыванию эффектов взаимодействий наследуемым генетическим вариациям.
Критическим аргументом против большого влияния взаимодействий GxE является требование согласованности данных разных методов. Например, если взаимодействие генов и среды ставить во главу угла объяснения разницы между наследуемостью, рассчитанной по методам близнецов и методам геномного анализа, то должны наблюдаться определённые закономерности, которые, тем не менее, фактически не подтверждаются. Среди них — линейное снижение коэффициента корреляции фенотипа с генетическим сходством родственников разных степеней, отсутствие разницы в прогностической силе полигенных шкал при оценке внутрисемейных и внесемейных выборок, а также отсутствие необычно высокого вклада общего семейного окружения в наследуемость. Важно и то, что анализ генетической наследуемости в популяциях с разным происхождением вызывает дополнительные сложности. Популяционная стратификация и различия в структуре генома между этническими группами осложняют переносимость результатов исследований, основанных на выборках европейского происхождения, на другие популяции.
Полигенные оценки, созданные на данных европеоидных выборок, могут ошибочно интерпретировать социально-культурные и исторические факторы как генетические, что приводит к нежелательным и даже опасным ошибочным выводам относительно разницы в способностях между этническими группами. Кроме методологических и теоретических проблем, область генетики сталкивается с технологическими ограничениями. Традиционные методы геномного секвенирования, в основном построенные на коротких чтениях ДНК (short-read sequencing), недостаточно полно отражают структуру и вариации генома, особенно в повторных и структурно сложных участках. Эти технологии плохо выявляют крупные структурные варианты и редкие мутации, что может быть одной из причин «недостающей» наследуемости. Современные методы секвенирования с длинными чтениями (long-read sequencing) способны значительно расширить спектр выявляемых генетических вариаций, включая сложные структурные изменения и вариации в трудно секвенируемых регионах.
Это открывает перспективу более полного понимания генетических детерминант фенотипа и устранения ошибок, связанных с пропусками данных при использовании устаревших технологий. Тем не менее, переход к новым технологиям сопровождается вопросами о стоимости, надёжности и совместимости с существующими массивами данных. Не все учёные и проекты готовы немедленно полностью перейти на long-read секвенирование, однако накопление больших наборов таких данных обещает существенные прорывы в ближайшие годы. Дискуссии вокруг недостающей наследственности дополнительно осложняются особенностями социального восприятия и интерпретаций результатов генетики. Некоторые учёные поднимают вопрос ответственности в том, как результаты используются в публичных дебатах, предупреждая об опасности злоупотреблений, которые могут привести к оправданию ложных стереотипов и социальной несправедливости.
Подводя итог, можно сказать, что загадка недостающей наследственности отражает гораздо более сложную картину генетических и экологических взаимодействий, чем предполагалось ранее. Современное состояние исследований демонстрирует, что классические оценки наследственности, основанные на близнецах и родственниках, должны рассматриваться с осторожностью, учитывая предпосылки и ограничения этих методов. Параллельно с этим, полногеномные исследования и новейшие технологические достижения позволяют постепенно выявлять те генетические эффекты, которые ранее оставались невидимыми. Исследования в области взаимодействий генов, среды и их корреляций, а также развитие вычислительных методов и моделей многоуровневых взаимодействий, обещают дать более точные, обоснованные и информативные оценки биоразнообразия фенотипов. В итоге генетика находится на этапе интенсивного переосмысления методологических подходов и научных парадигм, что является неотъемлемым этапом любого научного развития.
Консенсус ещё далеко не достигнут, но широкие и подробные обсуждения с учётом разнообразных позиций и новых данных дают основания надеяться на появление более полной и точной картины взаимосвязи генов и проявления признаков в человеческих популяциях.